MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 15230

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022784	GCG	2	6	242018	242023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625472
3002	NC_022784	ATGA	2	8	242093	242100	50 %	25 %	25 %	0 %	557625472
3003	NC_022784	GTT	2	6	242185	242190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625472
3004	NC_022784	TGT	2	6	242205	242210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557626120
3005	NC_022784	CG	3	6	242235	242240	0 %	0 %	50 %	50 %	557626120
3006	NC_022784	CGAC	2	8	242250	242257	25 %	0 %	25 %	50 %	557626120
3007	NC_022784	CAT	2	6	242720	242725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625473
3008	NC_022784	AGTA	2	8	242807	242814	50 %	25 %	25 %	0 %	557625473
3009	NC_022784	ATCA	2	8	242830	242837	50 %	25 %	0 %	25 %	557625473
3010	NC_022784	G	6	6	242904	242909	0 %	0 %	100 %	0 %	557625473
3011	NC_022784	GAT	2	6	242913	242918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625473
3012	NC_022784	ATG	2	6	242992	242997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625473
3013	NC_022784	AGG	2	6	243037	243042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625473
3014	NC_022784	ATTG	2	8	243053	243060	25 %	50 %	25 %	0 %	557625473
3015	NC_022784	ACGA	2	8	243096	243103	50 %	0 %	25 %	25 %	557625473
3016	NC_022784	T	6	6	243108	243113	0 %	100 %	0 %	0 %	557625473
3017	NC_022784	AT	3	6	243170	243175	50 %	50 %	0 %	0 %	557625473
3018	NC_022784	AAG	2	6	243181	243186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625473
3019	NC_022784	GAT	2	6	243281	243286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625473
3020	NC_022784	GGT	2	6	243351	243356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625473
3021	NC_022784	AAG	2	6	243438	243443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625473
3022	NC_022784	ACT	2	6	243496	243501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625473
3023	NC_022784	CTG	2	6	243533	243538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625473
3024	NC_022784	AGGG	2	8	243569	243576	25 %	0 %	75 %	0 %	557625473
3025	NC_022784	TC	3	6	243606	243611	0 %	50 %	0 %	50 %	557625473
3026	NC_022784	CA	3	6	243766	243771	50 %	0 %	0 %	50 %	557625473
3027	NC_022784	GAT	2	6	243866	243871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625473
3028	NC_022784	TGCA	2	8	244018	244025	25 %	25 %	25 %	25 %	557625473
3029	NC_022784	TAC	2	6	244074	244079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625473
3030	NC_022784	ACA	2	6	244111	244116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625473
3031	NC_022784	TGA	2	6	244247	244252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625473
3032	NC_022784	GAGG	2	8	244322	244329	25 %	0 %	75 %	0 %	557625473
3033	NC_022784	AAC	2	6	244404	244409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625473
3034	NC_022784	AT	4	8	244416	244423	50 %	50 %	0 %	0 %	557625473
3035	NC_022784	TACA	2	8	244455	244462	50 %	25 %	0 %	25 %	557625473
3036	NC_022784	TA	3	6	244505	244510	50 %	50 %	0 %	0 %	557625473
3037	NC_022784	CTGG	2	8	244542	244549	0 %	25 %	50 %	25 %	557625473
3038	NC_022784	TGG	2	6	244559	244564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625473
3039	NC_022784	AAG	2	6	244593	244598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625473
3040	NC_022784	TAA	2	6	244721	244726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625473
3041	NC_022784	TCA	2	6	244750	244755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625473
3042	NC_022784	TTC	2	6	244797	244802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625473
3043	NC_022784	CAG	2	6	244857	244862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625473
3044	NC_022784	GTG	2	6	244873	244878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625473
3045	NC_022784	GCC	2	6	244889	244894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625473
3046	NC_022784	GTT	2	6	244916	244921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625473
3047	NC_022784	A	6	6	244964	244969	100 %	0 %	0 %	0 %	557625473
3048	NC_022784	GCC	2	6	244983	244988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625473
3049	NC_022784	AAG	2	6	245013	245018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625473
3050	NC_022784	CG	3	6	245039	245044	0 %	0 %	50 %	50 %	557625473
3051	NC_022784	AGG	2	6	245127	245132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625473
3052	NC_022784	GTT	2	6	245135	245140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625473
3053	NC_022784	TGAT	2	8	245167	245174	25 %	50 %	25 %	0 %	557625473
3054	NC_022784	GAG	2	6	245262	245267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625473
3055	NC_022784	A	6	6	245269	245274	100 %	0 %	0 %	0 %	557625473
3056	NC_022784	ACC	2	6	245314	245319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625473
3057	NC_022784	AGTG	2	8	245370	245377	25 %	25 %	50 %	0 %	557625473
3058	NC_022784	TTC	2	6	245384	245389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625473
3059	NC_022784	A	6	6	245402	245407	100 %	0 %	0 %	0 %	557625473
3060	NC_022784	AG	3	6	245453	245458	50 %	0 %	50 %	0 %	557625473
3061	NC_022784	A	6	6	245612	245617	100 %	0 %	0 %	0 %	557625473
3062	NC_022784	TA	3	6	245618	245623	50 %	50 %	0 %	0 %	557625473
3063	NC_022784	A	6	6	245656	245661	100 %	0 %	0 %	0 %	557625473
3064	NC_022784	ATC	2	6	245875	245880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625473
3065	NC_022784	GC	3	6	246315	246320	0 %	0 %	50 %	50 %	557625474
3066	NC_022784	TGT	2	6	246331	246336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625474
3067	NC_022784	CGT	2	6	246388	246393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625474
3068	NC_022784	TTG	2	6	246459	246464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625474
3069	NC_022784	ATG	2	6	246567	246572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625474
3070	NC_022784	GCG	2	6	246629	246634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625474
3071	NC_022784	TTCC	2	8	246693	246700	0 %	50 %	0 %	50 %	557625474
3072	NC_022784	GCT	3	9	246793	246801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625474
3073	NC_022784	TG	3	6	246824	246829	0 %	50 %	50 %	0 %	557625474
3074	NC_022784	GAG	2	6	246832	246837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625474
3075	NC_022784	GCG	2	6	246846	246851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625474
3076	NC_022784	CAA	2	6	246875	246880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625474
3077	NC_022784	AGTT	2	8	246882	246889	25 %	50 %	25 %	0 %	557625474
3078	NC_022784	GGC	2	6	246940	246945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625474
3079	NC_022784	TGA	2	6	246951	246956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625474
3080	NC_022784	CG	3	6	246957	246962	0 %	0 %	50 %	50 %	557625474
3081	NC_022784	ATG	2	6	247074	247079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625474
3082	NC_022784	GCA	2	6	247134	247139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625474
3083	NC_022784	ATGCGC	2	12	247171	247182	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	557625474
3084	NC_022784	ACG	2	6	247193	247198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625474
3085	NC_022784	GC	4	8	247227	247234	0 %	0 %	50 %	50 %	557625474
3086	NC_022784	GCC	2	6	247250	247255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625474
3087	NC_022784	GCG	2	6	247272	247277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625474
3088	NC_022784	CT	3	6	247300	247305	0 %	50 %	0 %	50 %	557625474
3089	NC_022784	GCG	2	6	247320	247325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625474
3090	NC_022784	TGC	2	6	247333	247338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625474
3091	NC_022784	AGC	2	6	247357	247362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625474
3092	NC_022784	GCC	2	6	247376	247381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625474
3093	NC_022784	TGG	2	6	247399	247404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625474
3094	NC_022784	GGA	2	6	247456	247461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625474
3095	NC_022784	GTG	2	6	247472	247477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625474
3096	NC_022784	CGA	2	6	247497	247502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625474
3097	NC_022784	A	6	6	247502	247507	100 %	0 %	0 %	0 %	557625474
3098	NC_022784	GTT	2	6	247518	247523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625474
3099	NC_022784	T	6	6	249415	249420	0 %	100 %	0 %	0 %	557625475
3100	NC_022784	CTG	2	6	249451	249456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625475
3101	NC_022784	CTT	2	6	249483	249488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625475
3102	NC_022784	TTCT	2	8	249505	249512	0 %	75 %	0 %	25 %	557625475
3103	NC_022784	GCT	2	6	249519	249524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625475
3104	NC_022784	TG	3	6	249538	249543	0 %	50 %	50 %	0 %	557625475
3105	NC_022784	ACT	2	6	249557	249562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625475
3106	NC_022784	CAG	2	6	249627	249632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625475
3107	NC_022784	TGC	3	9	249641	249649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625475
3108	NC_022784	GTC	2	6	249667	249672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625475
3109	NC_022784	T	6	6	249679	249684	0 %	100 %	0 %	0 %	557625475
3110	NC_022784	TGG	2	6	249732	249737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625475
3111	NC_022784	GCTGG	2	10	249750	249759	0 %	20 %	60 %	20 %	557625475
3112	NC_022784	TGC	2	6	249763	249768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625475
3113	NC_022784	TTTG	2	8	249779	249786	0 %	75 %	25 %	0 %	557625475
3114	NC_022784	TGC	2	6	249824	249829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625476
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3117	NC_022784	GGA	2	6	249917	249922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625476
3118	NC_022784	GC	3	6	249944	249949	0 %	0 %	50 %	50 %	557625476
3119	NC_022784	TTC	2	6	249963	249968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625476
3120	NC_022784	GT	3	6	249990	249995	0 %	50 %	50 %	0 %	557625476
3121	NC_022784	CTG	2	6	250052	250057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625476
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3123	NC_022784	TGT	2	6	250110	250115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625476
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3230	NC_022784	T	6	6	258499	258504	0 %	100 %	0 %	0 %	557625483
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3241	NC_022784	TGT	2	6	258953	258958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625484
3242	NC_022784	CACAAG	2	12	258976	258987	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	557625484
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3244	NC_022784	CAG	2	6	259020	259025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625484
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3246	NC_022784	CAC	2	6	259107	259112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625484
3247	NC_022784	CGC	2	6	259114	259119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625484
3248	NC_022784	A	6	6	259138	259143	100 %	0 %	0 %	0 %	557625484
3249	NC_022784	GCT	2	6	259151	259156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625484
3250	NC_022784	CA	3	6	259194	259199	50 %	0 %	0 %	50 %	557625484
3251	NC_022784	CA	3	6	259202	259207	50 %	0 %	0 %	50 %	557625484
3252	NC_022784	AC	3	6	259214	259219	50 %	0 %	0 %	50 %	557625484
3253	NC_022784	A	6	6	259235	259240	100 %	0 %	0 %	0 %	557625484
3254	NC_022784	CAG	2	6	259272	259277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625484
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3261	NC_022784	AGC	2	6	260122	260127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625485
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3267	NC_022784	GTT	2	6	260256	260261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625485
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3313	NC_022784	CAG	2	6	262624	262629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625487
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3352	NC_022784	ATC	2	6	264490	264495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625488
3353	NC_022784	AAGC	2	8	264505	264512	50 %	0 %	25 %	25 %	557625488
3354	NC_022784	CCG	2	6	264584	264589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625488
3355	NC_022784	GCT	2	6	264591	264596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625488
3356	NC_022784	GCT	2	6	264714	264719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625488
3357	NC_022784	AG	4	8	264883	264890	50 %	0 %	50 %	0 %	557625488
3358	NC_022784	ACA	2	6	264998	265003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625488
3359	NC_022784	TGGT	2	8	265061	265068	0 %	50 %	50 %	0 %	557625488
3360	NC_022784	ACACCG	2	12	265088	265099	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	557625488
3361	NC_022784	G	6	6	265143	265148	0 %	0 %	100 %	0 %	557625488
3362	NC_022784	GAA	2	6	265371	265376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625488
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3364	NC_022784	AAGA	2	8	265501	265508	75 %	0 %	25 %	0 %	557625488
3365	NC_022784	TGA	2	6	265569	265574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625488
3366	NC_022784	TGA	2	6	265653	265658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625488
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3368	NC_022784	AGG	2	6	265685	265690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625488
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3491	NC_022784	AT	3	6	273919	273924	50 %	50 %	0 %	0 %	557625495
3492	NC_022784	ACA	2	6	273926	273931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625495
3493	NC_022784	GGT	2	6	273951	273956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625495
3494	NC_022784	GTG	2	6	273994	273999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625495
3495	NC_022784	GGTG	2	8	274035	274042	0 %	25 %	75 %	0 %	557625495
3496	NC_022784	AGG	2	6	274076	274081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625495
3497	NC_022784	AGC	2	6	274087	274092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625495
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3499	NC_022784	GTG	2	6	274201	274206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625495
3500	NC_022784	ATC	2	6	274251	274256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625495

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